Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BDH1Q02338 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BDH1Q02338 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BDH1Q02338 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BDH1Q02338 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BDH1Q02338 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BDH1Q02338 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BDH1Q02338 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms