Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HmgcrQ01237 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HmgcrQ01237 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HmgcrQ01237 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HmgcrQ01237 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HmgcrQ01237 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HmgcrQ01237 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HmgcrQ01237 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HmgcrQ01237 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HmgcrQ01237 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HmgcrQ01237 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HmgcrQ01237 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HmgcrQ01237 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HmgcrQ01237 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HmgcrQ01237 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HmgcrQ01237 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms