Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCN7AQ01118 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCN7AQ01118 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SCN7AQ01118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SCN7AQ01118 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCN7AQ01118 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCN7AQ01118 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCN7AQ01118 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCN7AQ01118 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SCN7AQ01118 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCN7AQ01118 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCN7AQ01118 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SCN7AQ01118 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SCN7AQ01118 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCN7AQ01118 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCN7AQ01118 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCN7AQ01118 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCN7AQ01118 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCN7AQ01118 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
SCN7AQ01118 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCN7AQ01118 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCN7AQ01118 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCN7AQ01118 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCN7AQ01118 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCN7AQ01118 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms