Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SelpQ01102 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SelpQ01102 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SelpQ01102 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SelpQ01102 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SelpQ01102 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SelpQ01102 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SelpQ01102 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SelpQ01102 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SelpQ01102 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SelpQ01102 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SelpQ01102 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SelpQ01102 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SelpQ01102 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SelpQ01102 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SelpQ01102 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SelpQ01102 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SelpQ01102 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SelpQ01102 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SelpQ01102 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SelpQ01102 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SelpQ01102 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SelpQ01102 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SelpQ01102 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SelpQ01102 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SelpQ01102 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SelpQ01102 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SelpQ01102 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SelpQ01102 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SelpQ01102 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SelpQ01102 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SelpQ01102 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SelpQ01102 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SelpQ01102 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SelpQ01102 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms