Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDC42EP1Q00587 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP1Q00587 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC42EP1Q00587 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDC42EP1Q00587 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC42EP1Q00587 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC42EP1Q00587 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP1Q00587 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP1Q00587 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP1Q00587 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC42EP1Q00587 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP1Q00587 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms