Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK17Q00537 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK17Q00537 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK17Q00537 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK17Q00537 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK17Q00537 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK17Q00537 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK17Q00537 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK17Q00537 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK17Q00537 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK17Q00537 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK17Q00537 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK17Q00537 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms