Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK16Q00536 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK16Q00536 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK16Q00536 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK16Q00536 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK16Q00536 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK16Q00536 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms