Protein–RNA interactions for Protein: Q00519

Xdh, Xanthine dehydrogenase/oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XdhQ00519 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XdhQ00519 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XdhQ00519 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XdhQ00519 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XdhQ00519 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XdhQ00519 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
XdhQ00519 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XdhQ00519 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XdhQ00519 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XdhQ00519 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
XdhQ00519 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XdhQ00519 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XdhQ00519 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
XdhQ00519 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XdhQ00519 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XdhQ00519 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XdhQ00519 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XdhQ00519 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XdhQ00519 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XdhQ00519 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
XdhQ00519 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XdhQ00519 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XdhQ00519 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XdhQ00519 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XdhQ00519 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XdhQ00519 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XdhQ00519 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XdhQ00519 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XdhQ00519 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XdhQ00519 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms