Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim43bP86448 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43bP86448 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43bP86448 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43bP86448 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43bP86448 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim43bP86448 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim43bP86448 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms