Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIM1P81133 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIM1P81133 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIM1P81133 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIM1P81133 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIM1P81133 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIM1P81133 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIM1P81133 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIM1P81133 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIM1P81133 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIM1P81133 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIM1P81133 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIM1P81133 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIM1P81133 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIM1P81133 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIM1P81133 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SIM1P81133 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIM1P81133 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIM1P81133 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIM1P81133 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIM1P81133 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SIM1P81133 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIM1P81133 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIM1P81133 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIM1P81133 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIM1P81133 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIM1P81133 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIM1P81133 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIM1P81133 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIM1P81133 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIM1P81133 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIM1P81133 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIM1P81133 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIM1P81133 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIM1P81133 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIM1P81133 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIM1P81133 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIM1P81133 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIM1P81133 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIM1P81133 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIM1P81133 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIM1P81133 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIM1P81133 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIM1P81133 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIM1P81133 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIM1P81133 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIM1P81133 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIM1P81133 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIM1P81133 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIM1P81133 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIM1P81133 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIM1P81133 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIM1P81133 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIM1P81133 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIM1P81133 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIM1P81133 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIM1P81133 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIM1P81133 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIM1P81133 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIM1P81133 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIM1P81133 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIM1P81133 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIM1P81133 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIM1P81133 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIM1P81133 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIM1P81133 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIM1P81133 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIM1P81133 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIM1P81133 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIM1P81133 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIM1P81133 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIM1P81133 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIM1P81133 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIM1P81133 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIM1P81133 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIM1P81133 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIM1P81133 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIM1P81133 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIM1P81133 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIM1P81133 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIM1P81133 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIM1P81133 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIM1P81133 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIM1P81133 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIM1P81133 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIM1P81133 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIM1P81133 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIM1P81133 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIM1P81133 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIM1P81133 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIM1P81133 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIM1P81133 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIM1P81133 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIM1P81133 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms