Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irx3P81067 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Irx3P81067 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Irx3P81067 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irx3P81067 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Irx3P81067 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Irx3P81067 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Irx3P81067 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Irx3P81067 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Irx3P81067 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Irx3P81067 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Irx3P81067 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irx3P81067 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irx3P81067 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irx3P81067 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Irx3P81067 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Irx3P81067 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx3P81067 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx3P81067 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 512.9 ms