Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx2P81066 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx2P81066 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx2P81066 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx2P81066 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx2P81066 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irx2P81066 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx2P81066 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx2P81066 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx2P81066 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx2P81066 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx2P81066 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx2P81066 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx2P81066 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx2P81066 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx2P81066 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx2P81066 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx2P81066 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx2P81066 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx2P81066 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx2P81066 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx2P81066 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx2P81066 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms