Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT83P78385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT83P78385 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT83P78385 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT83P78385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT83P78385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT83P78385 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT83P78385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT83P78385 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT83P78385 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT83P78385 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT83P78385 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT83P78385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT83P78385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT83P78385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT83P78385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT83P78385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT83P78385 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT83P78385 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT83P78385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT83P78385 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT83P78385 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT83P78385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT83P78385 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT83P78385 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT83P78385 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT83P78385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT83P78385 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT83P78385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT83P78385 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT83P78385 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT83P78385 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT83P78385 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT83P78385 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT83P78385 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT83P78385 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT83P78385 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT83P78385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT83P78385 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT83P78385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT83P78385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT83P78385 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT83P78385 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT83P78385 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT83P78385 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT83P78385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT83P78385 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KRT83P78385 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT83P78385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT83P78385 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT83P78385 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT83P78385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT83P78385 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT83P78385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT83P78385 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT83P78385 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT83P78385 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT83P78385 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT83P78385 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT83P78385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT83P78385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT83P78385 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT83P78385 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT83P78385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT83P78385 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT83P78385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT83P78385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT83P78385 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT83P78385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT83P78385 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT83P78385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT83P78385 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT83P78385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT83P78385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT83P78385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT83P78385 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT83P78385 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT83P78385 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT83P78385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT83P78385 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT83P78385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT83P78385 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT83P78385 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT83P78385 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT83P78385 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT83P78385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT83P78385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT83P78385 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT83P78385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT83P78385 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT83P78385 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT83P78385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT83P78385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT83P78385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT83P78385 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT83P78385 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT83P78385 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT83P78385 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT83P78385 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT83P78385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms