Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNTNAP1P78357 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNTNAP1P78357 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNTNAP1P78357 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CNTNAP1P78357 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTNAP1P78357 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNTNAP1P78357 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNTNAP1P78357 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTNAP1P78357 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTNAP1P78357 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms