Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tp53bp1P70399 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tp53bp1P70399 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tp53bp1P70399 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tp53bp1P70399 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tp53bp1P70399 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tp53bp1P70399 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tp53bp1P70399 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tp53bp1P70399 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tp53bp1P70399 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tp53bp1P70399 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tp53bp1P70399 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tp53bp1P70399 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tp53bp1P70399 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tp53bp1P70399 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tp53bp1P70399 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tp53bp1P70399 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tp53bp1P70399 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53bp1P70399 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tp53bp1P70399 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tp53bp1P70399 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tp53bp1P70399 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tp53bp1P70399 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tp53bp1P70399 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tp53bp1P70399 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms