Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shox2P70390 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Shox2P70390 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shox2P70390 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shox2P70390 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shox2P70390 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Shox2P70390 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shox2P70390 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shox2P70390 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shox2P70390 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shox2P70390 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shox2P70390 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shox2P70390 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shox2P70390 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shox2P70390 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shox2P70390 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shox2P70390 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shox2P70390 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shox2P70390 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms