Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Capza3P70190 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Capza3P70190 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capza3P70190 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capza3P70190 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capza3P70190 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capza3P70190 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Capza3P70190 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capza3P70190 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capza3P70190 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capza3P70190 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capza3P70190 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capza3P70190 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Capza3P70190 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capza3P70190 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capza3P70190 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capza3P70190 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms