Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acta1P68134 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Acta1P68134 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acta1P68134 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acta1P68134 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acta1P68134 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Acta1P68134 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acta1P68134 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acta1P68134 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acta1P68134 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acta1P68134 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acta1P68134 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acta1P68134 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acta1P68134 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acta1P68134 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta1P68134 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acta1P68134 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms