Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTC1P68032 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTC1P68032 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTC1P68032 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTC1P68032 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTC1P68032 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTC1P68032 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTC1P68032 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms