Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK2BP67870 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK2BP67870 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK2BP67870 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSNK2BP67870 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK2BP67870 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK2BP67870 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK2BP67870 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms