Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtnP63089 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtnP63089 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtnP63089 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtnP63089 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtnP63089 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtnP63089 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtnP63089 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtnP63089 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtnP63089 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtnP63089 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtnP63089 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtnP63089 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtnP63089 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtnP63089 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtnP63089 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtnP63089 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtnP63089 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtnP63089 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtnP63089 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtnP63089 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtnP63089 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtnP63089 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtnP63089 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtnP63089 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtnP63089 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtnP63089 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtnP63089 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtnP63089 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtnP63089 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtnP63089 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PtnP63089 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtnP63089 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtnP63089 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtnP63089 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtnP63089 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtnP63089 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtnP63089 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtnP63089 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtnP63089 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtnP63089 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtnP63089 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtnP63089 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtnP63089 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtnP63089 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtnP63089 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtnP63089 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtnP63089 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtnP63089 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtnP63089 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtnP63089 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtnP63089 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtnP63089 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtnP63089 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtnP63089 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtnP63089 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtnP63089 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtnP63089 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtnP63089 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtnP63089 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtnP63089 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtnP63089 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtnP63089 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtnP63089 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtnP63089 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtnP63089 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtnP63089 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtnP63089 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtnP63089 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtnP63089 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms