Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp2P63044 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp2P63044 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp2P63044 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp2P63044 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp2P63044 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp2P63044 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp2P63044 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp2P63044 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp2P63044 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vamp2P63044 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp2P63044 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp2P63044 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms