Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRA2BP62995 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRA2BP62995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRA2BP62995 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRA2BP62995 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRA2BP62995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRA2BP62995 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms