Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P62891 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P62891 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P62891 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL39P62891 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P62891 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P62891 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P62891 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL39P62891 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P62891 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P62891 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL39P62891 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P62891 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P62891 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL39P62891 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL39P62891 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL39P62891 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL39P62891 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL39P62891 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL39P62891 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL39P62891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL39P62891 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL39P62891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL39P62891 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL39P62891 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL39P62891 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL39P62891 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL39P62891 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL39P62891 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL39P62891 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL39P62891 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL39P62891 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL39P62891 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL39P62891 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL39P62891 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL39P62891 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL39P62891 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL39P62891 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL39P62891 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P62891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P62891 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P62891 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P62891 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P62891 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P62891 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P62891 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P62891 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P62891 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P62891 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P62891 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P62891 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P62891 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P62891 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P62891 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P62891 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P62891 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P62891 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P62891 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P62891 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P62891 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P62891 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL39P62891 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P62891 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P62891 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P62891 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P62891 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P62891 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P62891 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P62891 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P62891 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P62891 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P62891 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P62891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P62891 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P62891 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P62891 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P62891 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P62891 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P62891 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P62891 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P62891 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL39P62891 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL39P62891 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P62891 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P62891 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P62891 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms