Protein–RNA interactions for Protein: P62508

ESRRG, Estrogen-related receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRGP62508 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRGP62508 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRGP62508 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESRRGP62508 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESRRGP62508 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRGP62508 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ESRRGP62508 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ESRRGP62508 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ESRRGP62508 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ESRRGP62508 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ESRRGP62508 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms