Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11AP62491 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11AP62491 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11AP62491 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11AP62491 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11AP62491 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11AP62491 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11AP62491 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11AP62491 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11AP62491 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11AP62491 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11AP62491 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11AP62491 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11AP62491 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11AP62491 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11AP62491 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11AP62491 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11AP62491 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11AP62491 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11AP62491 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11AP62491 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11AP62491 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11AP62491 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms