Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm3P62311 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm3P62311 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm3P62311 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm3P62311 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm3P62311 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm3P62311 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms