Protein–RNA interactions for Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-206ENST00000470807 668 ntTSL 314.03□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 PRSS21-203ENST00000570594 809 ntTSL 313.95□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 213.9□□□□□ -0.182e-8■□□□□ 9.6
RPS11P62280 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.527e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-214ENST00000493998 404 ntTSL 210.26□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 PRSS21-204ENST00000570629 626 ntTSL 210.19□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.87e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.887e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 39.36□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.027e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.797e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 216.3■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.461e-323■□□□□ 9.4
RPS11P62280 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-11■□□□□ 9.1
RPS11P62280 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt11.11□□□□□ -0.633e-11■□□□□ 9.1
RPS11P62280 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.573e-11■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 521.33■■□□□ 1.011e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 46.32□□□□□ -1.41e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 54.42□□□□□ -1.71e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 43.96□□□□□ -1.781e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 52.52□□□□□ -2.011e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.151e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.417e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.287e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 214.62□□□□□ -0.077e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 313.21□□□□□ -0.297e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-215ENST00000590494 702 ntTSL 29.81□□□□□ -0.847e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.657e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.351e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 216.96■□□□□ 0.311e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 515.51■□□□□ 0.071e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.251e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 412.98□□□□□ -0.331e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 412.69□□□□□ -0.381e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 412.31□□□□□ -0.441e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 38.66□□□□□ -1.021e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 38.38□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.346e-8■□□□□ 8.8
RPS11P62280 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.366e-8■□□□□ 8.8
RPS11P62280 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.566e-8■□□□□ 8.8
RPS11P62280 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.038e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 219.82■□□□□ 0.768e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.548e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.288e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.178e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 UBAC1-203ENST00000471163 838 ntTSL 313.18□□□□□ -0.38e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 513.09□□□□□ -0.318e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-208ENST00000498636 959 ntTSL 311.22□□□□□ -0.618e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 215.81■□□□□ 0.124e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 314.84□□□□□ -0.034e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 28.04□□□□□ -1.124e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 8.6
RPS11P62280 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.713e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 8.5
Retrieved 100 of 539 protein–RNA pairs in 16.8 ms