Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vbp1P61759 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vbp1P61759 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vbp1P61759 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vbp1P61759 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vbp1P61759 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vbp1P61759 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vbp1P61759 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vbp1P61759 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms