Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCALDP61601 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCALDP61601 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCALDP61601 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCALDP61601 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCALDP61601 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCALDP61601 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCALDP61601 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCALDP61601 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCALDP61601 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCALDP61601 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCALDP61601 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCALDP61601 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCALDP61601 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCALDP61601 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCALDP61601 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCALDP61601 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCALDP61601 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCALDP61601 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCALDP61601 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCALDP61601 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCALDP61601 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCALDP61601 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCALDP61601 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCALDP61601 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCALDP61601 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCALDP61601 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCALDP61601 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCALDP61601 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCALDP61601 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCALDP61601 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCALDP61601 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCALDP61601 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCALDP61601 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCALDP61601 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCALDP61601 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCALDP61601 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCALDP61601 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCALDP61601 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCALDP61601 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCALDP61601 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCALDP61601 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCALDP61601 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCALDP61601 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCALDP61601 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCALDP61601 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCALDP61601 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCALDP61601 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCALDP61601 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCALDP61601 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCALDP61601 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCALDP61601 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCALDP61601 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCALDP61601 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCALDP61601 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCALDP61601 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCALDP61601 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCALDP61601 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCALDP61601 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCALDP61601 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCALDP61601 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCALDP61601 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCALDP61601 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCALDP61601 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCALDP61601 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCALDP61601 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCALDP61601 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCALDP61601 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCALDP61601 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCALDP61601 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCALDP61601 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCALDP61601 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCALDP61601 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCALDP61601 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCALDP61601 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCALDP61601 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCALDP61601 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCALDP61601 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCALDP61601 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCALDP61601 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCALDP61601 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCALDP61601 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCALDP61601 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCALDP61601 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCALDP61601 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NCALDP61601 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCALDP61601 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCALDP61601 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCALDP61601 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCALDP61601 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCALDP61601 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCALDP61601 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCALDP61601 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCALDP61601 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCALDP61601 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCALDP61601 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCALDP61601 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCALDP61601 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCALDP61601 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCALDP61601 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms