Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab10P61027 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab10P61027 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab10P61027 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab10P61027 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab10P61027 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab10P61027 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab10P61027 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab10P61027 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab10P61027 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab10P61027 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab10P61027 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab10P61027 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab10P61027 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab10P61027 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab10P61027 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab10P61027 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab10P61027 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab10P61027 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab10P61027 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab10P61027 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab10P61027 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab10P61027 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab10P61027 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab10P61027 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms