Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBP60709 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBP60709 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBP60709 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBP60709 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBP60709 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBP60709 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTBP60709 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTBP60709 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTBP60709 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTBP60709 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBP60709 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTBP60709 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTBP60709 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTBP60709 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTBP60709 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTBP60709 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTBP60709 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTBP60709 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTBP60709 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTBP60709 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTBP60709 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBP60709 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTBP60709 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTBP60709 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTBP60709 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTBP60709 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTBP60709 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTBP60709 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTBP60709 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTBP60709 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTBP60709 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTBP60709 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTBP60709 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTBP60709 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBP60709 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBP60709 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBP60709 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTBP60709 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTBP60709 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBP60709 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBP60709 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBP60709 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBP60709 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBP60709 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTBP60709 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTBP60709 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTBP60709 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTBP60709 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTBP60709 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTBP60709 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTBP60709 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTBP60709 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTBP60709 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTBP60709 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTBP60709 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTBP60709 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTBP60709 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTBP60709 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBP60709 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBP60709 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBP60709 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBP60709 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBP60709 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBP60709 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBP60709 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBP60709 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBP60709 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBP60709 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBP60709 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTBP60709 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTBP60709 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTBP60709 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTBP60709 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTBP60709 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTBP60709 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBP60709 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBP60709 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBP60709 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBP60709 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTBP60709 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTBP60709 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTBP60709 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTBP60709 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTBP60709 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTBP60709 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTBP60709 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTBP60709 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms