Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABARAPL2P60520 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABARAPL2P60520 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL2P60520 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABARAPL2P60520 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPL2P60520 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABARAPL2P60520 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms