Protein–RNA interactions for Protein: P56842

Tcl1b3, Protein TCL1B3, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b3P56842 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcl1b3P56842 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcl1b3P56842 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcl1b3P56842 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcl1b3P56842 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcl1b3P56842 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcl1b3P56842 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms