Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL4CP56559 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL4CP56559 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARL4CP56559 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARL4CP56559 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARL4CP56559 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARL4CP56559 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL4CP56559 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARL4CP56559 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARL4CP56559 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARL4CP56559 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4CP56559 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARL4CP56559 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms