Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAG2P55895 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAG2P55895 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAG2P55895 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAG2P55895 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAG2P55895 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAG2P55895 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAG2P55895 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAG2P55895 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAG2P55895 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAG2P55895 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAG2P55895 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAG2P55895 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAG2P55895 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAG2P55895 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAG2P55895 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAG2P55895 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAG2P55895 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAG2P55895 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAG2P55895 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAG2P55895 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAG2P55895 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAG2P55895 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAG2P55895 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAG2P55895 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAG2P55895 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAG2P55895 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAG2P55895 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAG2P55895 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAG2P55895 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAG2P55895 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAG2P55895 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAG2P55895 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAG2P55895 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAG2P55895 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAG2P55895 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAG2P55895 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAG2P55895 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAG2P55895 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAG2P55895 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAG2P55895 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAG2P55895 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAG2P55895 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAG2P55895 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAG2P55895 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAG2P55895 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAG2P55895 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAG2P55895 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAG2P55895 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAG2P55895 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAG2P55895 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAG2P55895 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAG2P55895 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAG2P55895 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAG2P55895 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAG2P55895 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAG2P55895 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAG2P55895 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAG2P55895 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAG2P55895 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAG2P55895 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAG2P55895 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAG2P55895 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAG2P55895 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAG2P55895 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAG2P55895 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAG2P55895 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAG2P55895 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAG2P55895 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAG2P55895 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAG2P55895 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAG2P55895 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAG2P55895 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAG2P55895 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAG2P55895 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAG2P55895 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAG2P55895 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAG2P55895 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAG2P55895 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAG2P55895 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAG2P55895 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAG2P55895 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAG2P55895 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAG2P55895 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAG2P55895 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAG2P55895 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAG2P55895 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAG2P55895 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAG2P55895 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAG2P55895 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAG2P55895 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAG2P55895 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAG2P55895 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAG2P55895 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAG2P55895 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAG2P55895 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAG2P55895 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAG2P55895 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAG2P55895 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAG2P55895 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms