Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF3BP55884 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF3BP55884 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3BP55884 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EIF3BP55884 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3BP55884 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF3BP55884 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EIF3BP55884 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms