Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX9P55771 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX9P55771 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX9P55771 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX9P55771 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAX9P55771 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX9P55771 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX9P55771 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX9P55771 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX9P55771 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX9P55771 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX9P55771 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX9P55771 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX9P55771 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX9P55771 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX9P55771 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX9P55771 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX9P55771 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX9P55771 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX9P55771 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX9P55771 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX9P55771 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX9P55771 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX9P55771 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX9P55771 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX9P55771 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX9P55771 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX9P55771 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX9P55771 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX9P55771 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX9P55771 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX9P55771 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX9P55771 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX9P55771 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX9P55771 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX9P55771 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX9P55771 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX9P55771 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX9P55771 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX9P55771 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX9P55771 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX9P55771 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX9P55771 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX9P55771 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX9P55771 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX9P55771 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAX9P55771 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX9P55771 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX9P55771 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAX9P55771 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX9P55771 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX9P55771 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX9P55771 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX9P55771 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAX9P55771 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAX9P55771 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAX9P55771 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAX9P55771 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX9P55771 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAX9P55771 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAX9P55771 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX9P55771 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX9P55771 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX9P55771 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX9P55771 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX9P55771 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX9P55771 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX9P55771 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX9P55771 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX9P55771 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX9P55771 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX9P55771 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX9P55771 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX9P55771 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX9P55771 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX9P55771 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX9P55771 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX9P55771 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX9P55771 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX9P55771 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX9P55771 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX9P55771 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX9P55771 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX9P55771 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX9P55771 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX9P55771 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX9P55771 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX9P55771 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX9P55771 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX9P55771 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX9P55771 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX9P55771 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX9P55771 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX9P55771 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.6 ms