Protein–RNA interactions for Protein: P55085

F2RL1, Proteinase-activated receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2RL1P55085 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
F2RL1P55085 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
F2RL1P55085 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
F2RL1P55085 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F2RL1P55085 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F2RL1P55085 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms