Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GEMP55040 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GEMP55040 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEMP55040 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEMP55040 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEMP55040 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEMP55040 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEMP55040 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GEMP55040 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GEMP55040 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GEMP55040 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEMP55040 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GEMP55040 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GEMP55040 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEMP55040 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEMP55040 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEMP55040 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GEMP55040 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GEMP55040 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GEMP55040 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GEMP55040 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GEMP55040 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GEMP55040 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GEMP55040 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GEMP55040 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEMP55040 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEMP55040 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEMP55040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMP55040 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMP55040 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMP55040 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMP55040 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMP55040 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMP55040 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMP55040 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEMP55040 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEMP55040 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEMP55040 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEMP55040 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEMP55040 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GEMP55040 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GEMP55040 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GEMP55040 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEMP55040 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEMP55040 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEMP55040 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEMP55040 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMP55040 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMP55040 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMP55040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMP55040 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEMP55040 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMP55040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEMP55040 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMP55040 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMP55040 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMP55040 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMP55040 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMP55040 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEMP55040 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEMP55040 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEMP55040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GEMP55040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMP55040 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMP55040 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GEMP55040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMP55040 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GEMP55040 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GEMP55040 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GEMP55040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMP55040 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMP55040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GEMP55040 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMP55040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMP55040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMP55040 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMP55040 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GEMP55040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GEMP55040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEMP55040 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GEMP55040 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GEMP55040 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMP55040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GEMP55040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GEMP55040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GEMP55040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GEMP55040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GEMP55040 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMP55040 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GEMP55040 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMP55040 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMP55040 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMP55040 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMP55040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GEMP55040 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEMP55040 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEMP55040 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GEMP55040 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEMP55040 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GEMP55040 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms