Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GYS2P54840 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GYS2P54840 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GYS2P54840 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GYS2P54840 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GYS2P54840 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GYS2P54840 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GYS2P54840 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GYS2P54840 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GYS2P54840 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GYS2P54840 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GYS2P54840 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GYS2P54840 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GYS2P54840 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GYS2P54840 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GYS2P54840 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GYS2P54840 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GYS2P54840 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GYS2P54840 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GYS2P54840 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GYS2P54840 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GYS2P54840 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GYS2P54840 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GYS2P54840 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GYS2P54840 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GYS2P54840 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GYS2P54840 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GYS2P54840 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GYS2P54840 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GYS2P54840 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GYS2P54840 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GYS2P54840 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GYS2P54840 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GYS2P54840 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GYS2P54840 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GYS2P54840 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GYS2P54840 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GYS2P54840 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GYS2P54840 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GYS2P54840 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GYS2P54840 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GYS2P54840 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GYS2P54840 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GYS2P54840 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GYS2P54840 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GYS2P54840 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GYS2P54840 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GYS2P54840 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GYS2P54840 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GYS2P54840 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GYS2P54840 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GYS2P54840 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GYS2P54840 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GYS2P54840 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GYS2P54840 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GYS2P54840 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GYS2P54840 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GYS2P54840 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GYS2P54840 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GYS2P54840 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GYS2P54840 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GYS2P54840 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GYS2P54840 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GYS2P54840 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GYS2P54840 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GYS2P54840 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GYS2P54840 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GYS2P54840 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GYS2P54840 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GYS2P54840 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GYS2P54840 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GYS2P54840 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GYS2P54840 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GYS2P54840 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GYS2P54840 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GYS2P54840 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GYS2P54840 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GYS2P54840 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GYS2P54840 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GYS2P54840 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GYS2P54840 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GYS2P54840 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GYS2P54840 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GYS2P54840 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GYS2P54840 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GYS2P54840 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GYS2P54840 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GYS2P54840 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GYS2P54840 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GYS2P54840 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GYS2P54840 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GYS2P54840 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GYS2P54840 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GYS2P54840 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms