Protein–RNA interactions for Protein: P54803

GALC, Galactocerebrosidase, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALCP54803 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GALCP54803 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GALCP54803 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GALCP54803 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GALCP54803 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GALCP54803 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GALCP54803 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GALCP54803 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GALCP54803 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GALCP54803 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GALCP54803 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GALCP54803 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GALCP54803 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GALCP54803 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GALCP54803 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALCP54803 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GALCP54803 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALCP54803 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GALCP54803 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GALCP54803 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GALCP54803 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GALCP54803 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GALCP54803 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GALCP54803 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GALCP54803 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GALCP54803 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GALCP54803 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GALCP54803 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GALCP54803 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GALCP54803 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GALCP54803 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GALCP54803 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GALCP54803 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GALCP54803 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GALCP54803 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GALCP54803 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GALCP54803 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GALCP54803 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GALCP54803 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GALCP54803 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GALCP54803 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GALCP54803 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GALCP54803 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GALCP54803 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GALCP54803 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GALCP54803 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GALCP54803 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GALCP54803 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GALCP54803 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GALCP54803 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GALCP54803 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GALCP54803 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALCP54803 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALCP54803 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALCP54803 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GALCP54803 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GALCP54803 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GALCP54803 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GALCP54803 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GALCP54803 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GALCP54803 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GALCP54803 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GALCP54803 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GALCP54803 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GALCP54803 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GALCP54803 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GALCP54803 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GALCP54803 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALCP54803 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GALCP54803 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALCP54803 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALCP54803 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALCP54803 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALCP54803 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALCP54803 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GALCP54803 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALCP54803 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALCP54803 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALCP54803 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GALCP54803 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GALCP54803 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GALCP54803 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GALCP54803 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GALCP54803 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALCP54803 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALCP54803 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GALCP54803 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALCP54803 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALCP54803 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALCP54803 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALCP54803 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALCP54803 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALCP54803 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALCP54803 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALCP54803 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALCP54803 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALCP54803 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALCP54803 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALCP54803 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALCP54803 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms