Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ephb3P54754 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ephb3P54754 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ephb3P54754 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ephb3P54754 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ephb3P54754 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ephb3P54754 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ephb3P54754 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ephb3P54754 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ephb3P54754 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ephb3P54754 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ephb3P54754 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms