Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AP3M2P53677 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3M2P53677 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3M2P53677 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP3M2P53677 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP3M2P53677 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
AP3M2P53677 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3M2P53677 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms