Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRYBA4P53673 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYBA4P53673 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRYBA4P53673 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRYBA4P53673 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRYBA4P53673 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms