Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-5P52952 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX2-5P52952 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-5P52952 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX2-5P52952 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-5P52952 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-5P52952 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms