Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA4P52798 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA4P52798 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA4P52798 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA4P52798 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA4P52798 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA4P52798 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFNA4P52798 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA4P52798 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA4P52798 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms