Protein–RNA interactions for Protein: P52594

AGFG1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGFG1P52594 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGFG1P52594 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGFG1P52594 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGFG1P52594 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGFG1P52594 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGFG1P52594 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGFG1P52594 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms