Protein–RNA interactions for Protein: P51959

CCNG1, Cyclin-G1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNG1P51959 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNG1P51959 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNG1P51959 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCNG1P51959 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNG1P51959 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNG1P51959 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNG1P51959 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNG1P51959 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNG1P51959 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms