Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK2P51955 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK2P51955 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK2P51955 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK2P51955 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK2P51955 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK2P51955 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK2P51955 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK2P51955 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK2P51955 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEK2P51955 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK2P51955 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK2P51955 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK2P51955 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK2P51955 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK2P51955 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK2P51955 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK2P51955 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK2P51955 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK2P51955 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK2P51955 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK2P51955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK2P51955 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK2P51955 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK2P51955 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK2P51955 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK2P51955 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK2P51955 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK2P51955 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK2P51955 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK2P51955 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK2P51955 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEK2P51955 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK2P51955 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK2P51955 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK2P51955 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK2P51955 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK2P51955 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK2P51955 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK2P51955 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK2P51955 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK2P51955 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK2P51955 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK2P51955 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK2P51955 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK2P51955 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK2P51955 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK2P51955 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK2P51955 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK2P51955 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK2P51955 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK2P51955 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK2P51955 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK2P51955 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK2P51955 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK2P51955 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK2P51955 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK2P51955 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK2P51955 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK2P51955 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK2P51955 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK2P51955 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK2P51955 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK2P51955 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK2P51955 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK2P51955 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK2P51955 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK2P51955 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK2P51955 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK2P51955 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK2P51955 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK2P51955 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK2P51955 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK2P51955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK2P51955 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK2P51955 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK2P51955 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK2P51955 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK2P51955 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK2P51955 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK2P51955 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK2P51955 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK2P51955 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK2P51955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK2P51955 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK2P51955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK2P51955 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK2P51955 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK2P51955 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK2P51955 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK2P51955 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK2P51955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK2P51955 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK2P51955 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK2P51955 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK2P51955 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK2P51955 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK2P51955 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK2P51955 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK2P51955 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms